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慢病毒實(shí)驗(yàn)相關(guān)操作方法與問(wèn)題解答
閱讀次數(shù):580 發(fā)布時(shí)間:2021/12/27 10:49:37
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慢病毒(Lentivirus)是以人類免疫缺陷型病毒(HIV)為基礎(chǔ)發(fā)展起來(lái)的基因治療載體,它可以感染分裂細(xì)胞和非分裂細(xì)胞,可有效地感染包括幾乎所有的哺乳動(dòng)物細(xì)胞、干細(xì)胞和原代細(xì)胞。此外,慢病毒具有嗜核性,可以將外源基因有效地整合到宿主染色體上,從而可以在體內(nèi)較長(zhǎng)期表達(dá)。慢病毒的多種優(yōu)點(diǎn),使它成為基因傳遞的強(qiáng)大而有效的工具,獲得了廣泛的應(yīng)用。因此,慢病毒成為了實(shí)驗(yàn)室的一大?。在使用慢病毒的過(guò)程中,我們會(huì)遇到一些問(wèn)題,比如細(xì)胞轉(zhuǎn)染效率低,細(xì)胞狀態(tài)差等等。為了在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中更好地使用慢病毒,我們應(yīng)該注意哪些問(wèn)題呢?
 

慢病毒載體是經(jīng)過(guò)處理的HIV,理論上對(duì)人體是無(wú)害的,但病毒仍然具有潛在的生物學(xué)危險(xiǎn),慢病毒相關(guān)實(shí)驗(yàn)需要在生物安全柜(BL-2別)內(nèi)進(jìn)行操作。因此在進(jìn)行操作的時(shí)候,我們要按照如下基礎(chǔ)規(guī)范進(jìn)行實(shí)驗(yàn):
1、在進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室工作時(shí),穿著實(shí)驗(yàn)服或隔離服,戴上手套和口罩;
2、操作病毒時(shí)請(qǐng)盡量使用生物安全柜,小心不要產(chǎn)生氣霧或液體飛濺;
3、如果使用普通超凈工作臺(tái)操作病毒,請(qǐng)?jiān)诖蜷_含有病毒的容器蓋子關(guān)閉超凈臺(tái)的風(fēng)機(jī)(由于超凈臺(tái)風(fēng)向外排,有可能將病毒吹向操作者),并盡快操作;盡量縮短開蓋后的病毒在關(guān)閉了排風(fēng)機(jī)的超凈臺(tái)中停留的時(shí)間,封閉所有含有病毒的容器、耗材、廢液后,再打開超凈臺(tái)風(fēng)機(jī);
4、如果操作時(shí)臺(tái)面有病毒污染,請(qǐng)立即用75%酒精加1%的SDS 溶液擦拭。接觸過(guò)病毒的槍頭,離心管,培養(yǎng)板,培養(yǎng)液請(qǐng)用75%酒精加1%的SDS 溶液或于84 消毒液浸泡過(guò)夜后棄去;
5、如需離心,應(yīng)使用密封性好的離心管,或用封口膜封口后離心;
6、實(shí)驗(yàn)結(jié)束,脫掉手套先消毒再摘除手套,隨后用肥皂洗手。

慢病毒的儲(chǔ)存與稀釋
1、病毒長(zhǎng)期儲(chǔ)存于-80℃冰箱,-20℃保存不要超過(guò)1周,4℃保存不要超過(guò)3天;
2、病毒的運(yùn)輸采用干冰,收到病毒液后若幾天內(nèi)用于實(shí)驗(yàn),可于4℃保存(于3天內(nèi)用完)。若短時(shí)間內(nèi)不用,收到病毒后應(yīng)立即放入-80℃冰箱進(jìn)行長(zhǎng)期保存。病毒使用過(guò)程中要避免反復(fù)凍融,否則會(huì)降低病毒滴度;
3、一般病毒可在-80℃存放1年,但存放時(shí)間超過(guò)6個(gè)月后使用,需重新檢測(cè)病毒滴度;
4、需要稀釋病毒時(shí),將病毒從-80℃冰箱中取出,置于冰上溶解,然后用PBS或培養(yǎng)基(不含血清)稀釋到所需濃度后輕柔混勻,盡快使用;

慢病毒的使用
預(yù)實(shí)驗(yàn)摸索慢病毒的佳MOI
每種細(xì)胞對(duì)慢病毒的敏感性不同,有些容易感染,有些不容易感染,不同慢病毒的熒光強(qiáng)度也有差異,所以進(jìn)行慢病毒操作實(shí)驗(yàn)之,先要了解MOI的概念,MOI(Multiplicity of Infection,感染復(fù)數(shù))是指病毒感染細(xì)胞的比例。

選擇合適的MOI值,病毒的感染效率以及目的蛋白的表達(dá)量越高,相對(duì)細(xì)胞的毒性越小。對(duì)于分裂活躍的細(xì)胞,比如293細(xì)胞MOI=1時(shí),95%以上的細(xì)胞均可以表達(dá)目的基因。而對(duì)于非分裂細(xì)胞,比如原代細(xì)胞,感染效率較低,MOI值可能達(dá)到200-300。我們建議通過(guò)比較不同MOI(比如0、1、5、10、50、100等)感染細(xì)胞MOI值的摸索。

1、感染一天,一般用24孔板接種2×10?個(gè)細(xì)胞,第二天病毒感染時(shí)的細(xì)胞匯合度達(dá)到40-50%左右;
2、MOI值的設(shè)置若有文獻(xiàn)參考,可以參考值為中心設(shè)置梯度覆蓋參考值,舉例:文獻(xiàn)中某細(xì)胞系慢病毒MOI值為10,則設(shè)置MOI梯度為2.5,5,10,20,40等;若無(wú)文獻(xiàn)參考可按10倍梯度稀釋進(jìn)行設(shè)置,每個(gè)梯度3次重復(fù);
注:(1)每孔加病毒量(μL)=MOI*細(xì)胞數(shù)/滴度(TU/mL)*10?
一般第二天按照細(xì)胞數(shù)倍增計(jì)算;如果病毒滴度很高,每孔加病毒量過(guò)少,可進(jìn)行稀釋后再加;Polybrene(常用濃度為5-10μg/mL)是否添加根據(jù)細(xì)胞種類及具體實(shí)驗(yàn)決定;
3、第三天(加病毒后12h-24h左右),棄去含病毒就培養(yǎng)基,更換新鮮培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng);
4、第五天,觀察熒光情況,并進(jìn)行拍照,確定適合MOI值;
5、對(duì)于生長(zhǎng)緩慢代謝慢的細(xì)胞,可以適當(dāng)延長(zhǎng)病毒感染時(shí)間,根據(jù)細(xì)胞狀態(tài)決定何時(shí)更換培養(yǎng)基,保持細(xì)胞的活性。

慢病毒感染目的細(xì)胞
1、通過(guò)感染預(yù)實(shí)驗(yàn),確定細(xì)胞接種密度、佳MOI等條件。正式實(shí)驗(yàn),調(diào)整并保持良好的細(xì)胞狀態(tài);
2、按實(shí)驗(yàn)需要將細(xì)胞鋪板(qPCR檢測(cè)用12孔板,WB檢測(cè)用6孔板或更大面積的培養(yǎng)皿),細(xì)胞數(shù)以第2天密度約40-50%為宜,37℃ 培養(yǎng)過(guò)夜;
3、感染,從-80℃冰箱取出病毒置于冰上融化,用PBS稀釋成所需濃度,用移液器吹打均勻;
4、感染給細(xì)胞換液,然后向每孔中均勻滴加稀釋好的病毒液,輕輕搖勻,37℃培養(yǎng)過(guò)夜;
5、感染后根據(jù)細(xì)胞狀態(tài)決定,更換新鮮的完全培養(yǎng)液,繼續(xù)37℃培養(yǎng)。若病毒對(duì)細(xì)胞無(wú)毒性也可不換液。感染后48-72h觀測(cè)熒光,拍照記錄;
6、根據(jù)需要,或收細(xì)胞抽提RNA檢測(cè)目的基因在mRNA水平的表達(dá),或收細(xì)胞抽提蛋白檢測(cè)目的蛋白的表達(dá),或收細(xì)胞進(jìn)行細(xì)胞功能檢測(cè);
7、在培養(yǎng)過(guò)程中,需要篩選穩(wěn)定攜帶 Puromycin 抗性基因的病毒,則需換上含適當(dāng)濃度 Puromycin 的新鮮完全培養(yǎng)液。

慢病毒在使用過(guò)程中可能遇到的其他問(wèn)題
如何使用慢病毒感染細(xì)胞?
使用慢病毒感染細(xì)胞的操作流程取決于細(xì)胞種類,因此先要了解細(xì)胞的來(lái)源和背景。通常來(lái)講先要根據(jù)MOI和需要感染細(xì)胞量計(jì)算所需要的病毒量,然后將所需病毒液加入培養(yǎng)體系后4小時(shí)左右即可換成完全培養(yǎng)基正常培養(yǎng)。
慢病毒染后為什么細(xì)胞中出現(xiàn)大量黑點(diǎn),并影響細(xì)胞生長(zhǎng)?
在排除細(xì)菌及真菌污染后,細(xì)胞中的黑點(diǎn)通常為細(xì)胞碎片,導(dǎo)致細(xì)胞破碎的原因有很多,但在慢病毒感染后,細(xì)胞破碎通常有兩個(gè)原因:
a. 慢病毒使用量過(guò)多,或細(xì)胞數(shù)量過(guò)少;
b. 支原體污染。由于輕度的支原體污染并不影響細(xì)胞的生長(zhǎng)和增殖,故支原體污染被許多實(shí)驗(yàn)室所忽略。
但支原體易在病毒感染細(xì)胞后爆發(fā),故會(huì)出現(xiàn)大量細(xì)胞碎片。建議在使用病毒制品時(shí),應(yīng)先排除細(xì)胞、培養(yǎng)物及培養(yǎng)環(huán)境中的支原體污染,以節(jié)約時(shí)間。

病毒感染目的細(xì)胞感染不上或效率低?
和以下幾個(gè)因素有關(guān):
1、病毒活性:解凍病毒一定要在冰上進(jìn)行,盡量避免反復(fù)凍融, -80 ℃ 保存半年以上需要重新測(cè)滴度;
2、目的細(xì)胞:好預(yù)實(shí)驗(yàn)測(cè)試過(guò),看病毒載體是否合適感染目的細(xì)胞。一些難感染的細(xì)胞,如懸浮細(xì)胞,原代細(xì)胞等,或者動(dòng)物實(shí)驗(yàn)適合用腺病毒或AAV;
3、MOI值:一般來(lái)說(shuō)MOI都是要用梯度法來(lái)摸索的,同的病毒感染不同的細(xì)胞的MOI值也不一樣,如果感染細(xì)胞所用的病毒量不夠的話,感染效率肯定不好;需要確認(rèn)MOI計(jì)算及細(xì)胞計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。
4、感染時(shí)間:慢病毒一般在感染后24h換液,感染后換液太早會(huì)導(dǎo)致感染效率下降;感染后換液太晚,則對(duì)細(xì)胞的損傷太大,效率也不高。感染后48h開始觀察熒光,由于慢病毒的表達(dá)時(shí)間較長(zhǎng),有的72h,120h才能看到熒光。
5、其他:是否加入 polybrene 以及熒光顯微鏡的使用等因素有關(guān)

要曝光很長(zhǎng)時(shí)間才能觀察到熒光?
要曝光很長(zhǎng)時(shí)間才能觀察到的熒光,說(shuō)明熒光比較弱,可能的原因有:
1、顯微鏡汞燈使用時(shí)間長(zhǎng),這個(gè)可以通過(guò)對(duì)照排除,看是否有比較亮的對(duì)照,或者如果有其他比較亮的樣品,證明不是汞燈的問(wèn)題。
2、PH值低,看培養(yǎng)基是否發(fā)黃導(dǎo)致綠色熒光猝滅。
3、目的病毒光不亮,插入目的基因后的病毒熒光強(qiáng)度與對(duì)照相比弱一些,這個(gè)屬于正,F(xiàn)象,增加曝光時(shí)間,看感染上的陽(yáng)性細(xì)胞比例如何,看看目的和對(duì)照的熒光的差異,如果感染比例尚可,差異不是很大,用Puromycin篩選有大量細(xì)胞存活,則病毒也可以使用。
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