公司新聞
是生活對我們這些實驗小可愛下手了嗎?
還是水逆沒過去?
為什么 WB 跑了這么多次,
都和預測差了這么多?
當然不是那些玄學流原因啦。讓我們科學地分析一下到底是哪里出了問題。
▪內(nèi)源性蛋白 or 重組蛋白
如果是內(nèi)源性蛋白還不打緊,如果是重組蛋白,那么馬上就要看一看重組蛋白是否為全長序列了。假如樣品是重組蛋白,還不是全長序列,那么條帶大小一定會和預測大小不一致。
▪多個 isoform 辨仔細
▲ SWISSPROT 會標出有些基因有多種 isoform
做著實驗,結果換了別的 isoform 可就一頓瞎忙活啦。
▪剪切活化要注意
如果在 SWISSPROT 或者權威的文獻里提到了,樣品的這個蛋白需要剪切活化,那么結果又要和預測值不同啦。
▪成倍增長多聚體
如果蛋白大小和預測值有明顯倍數(shù)關系,那就要考慮一下這個蛋白是不是二聚體或者多聚體啦。
▪蛋白修飾要變大
當 WB 大小和預測值不一致時:
1. 確定蛋白是內(nèi)源的還是外源的,如果是外源蛋白是不是全長序列;
2. SWISSPROT 數(shù)據(jù)庫查詢該蛋白是否有其他 isoform;
3. SWISSPROT 和文獻查詢蛋白質是否有剪切活化,剪切活化造成蛋白變;
4. 確定蛋白質是否是二聚體或多聚體。
5. NCBI 和 SWISSPROT 查詢蛋白質表達后是否有修飾,如有修飾會導致蛋白質增大;
以上就是遠慕生物給出的 5 條小貼士,拿去分析下自己的條帶問題絕對是綽綽有余了。如果用過了這 5 條,還是沒找到問題在哪里,那就要回過頭看看是不是預測不準或者實驗出錯啦。請輸入要搜索的關鍵詞
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