實(shí)驗(yàn)方法原理:
RNA 提取過(guò)程中*應(yīng)注意的是:組織或
細(xì)胞在變性液中完全裂解的同時(shí),如何抑 RNase 引起的 RNA 降解問(wèn)題。在直接加工新鮮組織時(shí),所有的細(xì)胞能盡可能快的接觸變性劑以完全裂解這一步是相當(dāng)重要的。一些難以加工的組織,例如:堅(jiān)硬的腫瘤、細(xì)菌細(xì)胞、植物根部等,即使使用勻漿器一般也不能很有效的裂解。此時(shí),通?梢栽谔幚斫M織時(shí),先對(duì)其進(jìn)行冷凍處理,以使之充分裂解。
為使迅速冷凍樣品,以使整塊組織徹底冷凍,因此,在冷凍前應(yīng)先將組織切成小塊,然后將其浸沒(méi)于液氮中。這將會(huì)使組織塊以*快的方式冷凍。另外,也可將一個(gè)金屬盤(pán)置于干冰上作為冷凍的表面,以對(duì)片狀的組織進(jìn)行快速的冷凍。
下面三種力法分別描述用三種不同的方式加工 0.lg 冷凍的小鼠肝臟組織,以產(chǎn)生組織/細(xì)胞裂解產(chǎn)物。裂解產(chǎn)物可進(jìn)行 RNA 的提取純化,或用于估計(jì) pdy(A)+RNA 的產(chǎn)量。雖然這三種方法同是利用胍緩沖液以徹底裂解細(xì)胞,但是它們?cè)谙惹暗牟襟E中,即如何加工組織或是在如何裂解的過(guò)程中有所不同。
實(shí)驗(yàn)步驟
方法一: 在勻漿器中加工冷凍的組織
產(chǎn)量:4.1ugpoly(A)ˉRNA
冷凍的組織在干冰上被切成大約 Cl5 cm2 的小片,轉(zhuǎn)人勻漿器中,一邊緩緩加入裂解緩沖液一邊不斷的勻漿。
方法二:通過(guò)注射器加工冷凍的組織。
產(chǎn)量:3.2ugpoly(A)-RNA。
冷凍的組織在干冰被切成大約 0.5 cm2 的小片,一邊緩緩加人裂解緩沖液一邊通過(guò) 18 號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)注射針頭反復(fù)抽打十次。
方法三:在液氮中將組織研磨成粉末。
產(chǎn)量:7.1ugpoly(A)ˉRNA。
將冷凍的樣品放在研缽中進(jìn)行劇烈研磨以使其粉碎。當(dāng)組織被磨成粉狀后,向研缽中加人變忭緩沖液,并攪拌均勻;旌衔锶诨髴(yīng)轉(zhuǎn)移到合適的容器中進(jìn)行進(jìn)一步的操作。在液氮中研磨組織至粉末狀,細(xì)胞的裂解則更完全,因此能得到比前兩種方法多近一倍的產(chǎn)量。
可見(jiàn),即使對(duì)于 N—種組織,采用同一種試劑進(jìn)行 RNA 的提取,僅僅由于組織樣品處理方法的不同,就導(dǎo)致了 RNA 提取量的顯著差異。因此,在對(duì)不同的組織進(jìn)行 RNA 提取時(shí),不僅要選擇*合適的提取方法,同時(shí)也要根據(jù)所處理的組織,以及提取目的以選擇*為合適的組織處理方法,只有這樣才能獲得*佳效果。
原創(chuàng)作者:上海遠(yuǎn)慕生物科技有限公司