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質(zhì)粒純度不高解決辦法
閱讀次數(shù):421 發(fā)布時(shí)間:2023/1/6 11:18:14
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 質(zhì)粒純度不高解決辦法
 
  1.混有蛋白:不要使用過多菌體。經(jīng)溶液P1、P2、P3處理,離心后溶液應(yīng)為澄清的,如果還混有微小蛋白懸浮物可再次離心去除后再進(jìn)行下一步驟。
 
  2. 混有RNA:RNaseA處理不徹/底,請(qǐng)減少菌體用量或加入溶液P3之后室溫放置一段時(shí)間。如果溶液P1已保存6個(gè)月以上,請(qǐng)?jiān)谌芤篜1中添加RNaseA。
 
  3. 混有基因組DNA:加入溶液P2和P3后應(yīng)溫和混勻,如果劇烈振蕩,可能把基因組DNA剪切成碎片從而混雜在質(zhì)粒中。如果加入溶液P2后過于粘稠,無法溫和混勻,請(qǐng)減少菌體用量。細(xì)菌培養(yǎng)時(shí)間過長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞和DNA的降解,培養(yǎng)時(shí)間不要超過16小時(shí)。
 
  4. P3溶液加入時(shí)間過長(zhǎng):P3溶液加入后,放置時(shí)間不要太長(zhǎng),否則有可能會(huì)產(chǎn)生小片段DNA污染。
 
  5. 含大量核酸酶的宿主菌:宿主菌含大量核酸酶,在質(zhì)粒提取過程中降解質(zhì)粒DNA,影響提取質(zhì)粒DNA的完整性,/好選用不含核酸酶的大腸桿菌宿主菌,如DH5α和Top10。
 
  6. 質(zhì)粒的二聚體和多聚體形式:質(zhì)粒復(fù)制過程中形成的,與宿主菌相關(guān),電泳可檢測(cè)出多條條帶,單酶切處理后可變成單一條帶。

質(zhì)粒純度不高解決辦法
 
  1.混有蛋白:不要使用過多菌體。經(jīng)溶液P1、P2、P3處理,離心后溶液應(yīng)為澄清的,如果還混有微小蛋白懸浮物可再次離心去除后再進(jìn)行下一步驟。
 
  2. 混有RNA:RNaseA處理不徹/底,請(qǐng)減少菌體用量或加入溶液P3之后室溫放置一段時(shí)間。如果溶液P1已保存6個(gè)月以上,請(qǐng)?jiān)谌芤篜1中添加RNaseA。
 
  3. 混有基因組DNA:加入溶液P2和P3后應(yīng)溫和混勻,如果劇烈振蕩,可能把基因組DNA剪切成碎片從而混雜在質(zhì)粒中。如果加入溶液P2后過于粘稠,無法溫和混勻,請(qǐng)減少菌體用量。細(xì)菌培養(yǎng)時(shí)間過長(zhǎng)會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞和DNA的降解,培養(yǎng)時(shí)間不要超過16小時(shí)。
 
  4. P3溶液加入時(shí)間過長(zhǎng):P3溶液加入后,放置時(shí)間不要太長(zhǎng),否則有可能會(huì)產(chǎn)生小片段DNA污染。
 
  5. 含大量核酸酶的宿主菌:宿主菌含大量核酸酶,在質(zhì)粒提取過程中降解質(zhì)粒DNA,影響提取質(zhì)粒DNA的完整性,/好選用不含核酸酶的大腸桿菌宿主菌,如DH5α和Top10。
 
  6. 質(zhì)粒的二聚體和多聚體形式:質(zhì)粒復(fù)制過程中形成的,與宿主菌相關(guān),電泳可檢測(cè)出多條條帶,單酶切處理后可變成單一條帶。
 

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